Obiekty hotelowe w czasie epidemii mogą znaleźć się w wyjątkowej sytuacji, która zmieni całkowicie ich przeznaczenie. Jeszcze przed wprowadzeniem rozporządzenia niektóre hotele zostały objęte kwarantanną ze względu na potwierdzenie w nich obecności osób zakażonych. Poza wszelką troską o zdrowie gości, personelu i własne, pozostaje kwestia rozliczenia pobytu, który według zaleceń GIS powinien trwać min. 14 dni. Zgodnie z obowiązującym w Polsce prawem koszty przymusowego pobytu w obiekcie hotelowym ponoszą biura podróży organizujące wyjazd lub indywidualni goście, którzy samodzielnie dokonali rezerwacji w obiekcie.

Drugą wyjątkową sytuacją, która może spotkać wiele obiektów noclegowych jest zmiana ich przeznaczenia na miejsce do prowadzenia kwarantanny osób zakażonych wirusem COVID-19. W tej sytuacji decyzję administracyjną w imieniu rządu podejmuje wojewoda, który również jest odpowiedzialny za pokrycie kosztów związanych z wykorzystaniem obiektu. Wszystkie organy administracji samorządowej miały już obowiązek przekazania informacji o obiektach, które mogą zostać wykorzystane do walki z rozprzestrzenianiem się koronawirusa. Typowane obiekty, to przede wszystkim takie, które są częściowo samowystarczalne i posiadają: własne zaplecze gastronomiczne, rozwinięty węzeł sanitarny (toalety w pokojach), pralnię, dodatkową przestrzeń do zagospodarowania (sale konferencyjne), łatwą logistykę wewnątrz budynku (windy, szerokie przejścia). Hotel, który decyzją administracyjną, staje się tymczasowym obiektem medycznym jest w całości przekazany do dyspozycji służbie zdrowia. Może w nim pozostać wyłącznie niezbędny personel, który zapewni bieżącą obsługę i funkcjonowanie obiektu.